Español: Figura 1. Estructura del cilio.

A) Representación esquemática de una sección transversal del axonema de un cilio primario, un cilio nodal y un cilio móvil.
El axonema del cilio se compone de nueve dobletes externos de microtúbulos que rodean un par central (9 + 2). El axonema está envuelto por una membrana ciliar. Los brazos internos y externos de dineína, la nexina y los radios radiales son los responsables de unir los microtúbulos y formar una estructura cilíndrica.

B) Diagrama esquemático de un cilio primario inmóvil típico. El cilio primario se divide en la punta ciliar, el axonema unido a la membrana que se extiende desde la superficie, la zona de transición y el complejo del cuerpo basal. Los extremos de la punta ciliar contienen moléculas de señalización y pueden sufrir cambios morfológicos en respuesta a los procesos de señalización. El axonema es el núcleo estructural de un cilio. La zona de transición convierte la estructura microtubular triplete del cuerpo basal en la estructura doblete axonemal. El bolsillo ciliar (collar) es una invaginación de la membrana plasmática en la raíz del cilio. El complejo del cuerpo basal comprende el cuerpo basal y su centríolo. En la mayoría de las células quiescentes, los centríolos se mueven hacia la membrana plasmática apical y el cuerpo basal (centríolo madre) funciona como el centro organizador de microtúbulos para nuclear los microtúbulos axonemales. El centríolo (centríolo hijo) permanece perpendicular al cuerpo basal.