GelGreen
| GelGreen | ||
|---|---|---|
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| General | ||
| Otros nombres | 10,10'-(6,22-dioxo-11,14,17-trioxa-7,21-diazaheptacosano-1,27-dil)bis(3,6-bis(dimetilamino)acridin-10-inio) yodato | |
| Fórmula estructural |
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| Fórmula molecular | C56H80I2N8O5 | |
| Identificadores | ||
| ChemSpider | 10032003 | |
| PubChem | 11857532 | |
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O=C
(NCCCOCCOCCOCCCNC(CCCCC[N+]1=C2C(C=CC(N(C)C)=C2)=CC3=C1C=C(N(C)C)C=C3)=O)CCCCC[N+]4=C5C(C=CC(N(C)C)=C5)=CC6=C4C=C(N(C)C)C=C6.[I-].[I-]
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InChI=1S/C56H78N8O5.2HI/c1-59(2)47-23-19-43-37-44-20-24-48(60(3)4)40-52(44)63(51(43)39-47)29-13-9-11-17-55(65)57-27-15-31-67-33-35-69-36-34-68-32-16-28-58-56(66)18-12-10-14-30-64-53-41-49(61(5)6)25-21-45(53)38-46-22-26-50(62(7)8)42-54(46)64;;/h19-26,37-42H,9-18,27-36H2,1-8H3;2*1H
Key: TWYVVGMYFLAQMU-UHFFFAOYSA-N | ||
| Propiedades físicas | ||
| Masa molar | 1198.43 g/mol g/mol | |
| Valores en el SI y en condiciones estándar (25 ℃ y 1 atm), salvo que se indique lo contrario. | ||
El GelGreen es un intercalante utilizado para teñir ácidos nucleicos en biología molecular para electroforesis en gel de agarosa. GelGreen está estructuralmente relacionado en forma estrecha con el naranja de acridina, y consiste en dos subunidades de naranja de acridina que se puentean mediante un espaciador.[1] El GelGreen permite teñir dsADN, ssADN o ARN.
Su fluoróforo, y por lo tanto sus propiedades ópticas, son esencialmente idénticas a los de otros compuestos del tipo naranja N-alquilacridina. Cuando se expone a la luz ultravioleta, presenta fluorescencia con un color verdoso que se intensifica fuertemente tras la unión a ADN.[2] La sustancia se comercializa como una alternativa menos tóxica y más sensible que el intercalante bromuro de etidio. El GelGreen se vende como una solución en DMSO o, más recientemente, en forma acuosa.
Características fisicoquímicas[editar]
| Característica | Valor |
|---|---|
| Fuerza por puente de hidrógeno aceptor | 9 |
| Fuerza por puente de hidrógeno donador | 2 |
| Número de giros | 30 |
| Coeficiente de reparto | 2.7 |
| Solubilidad (logS (mol/l)) | -12.9 |
| Superficie polar (Å 2) | 205.1 |
Referencias[editar]
- ↑ Biotium Inc., ed. (21 de agosto de 2012). «GelRed & GelGreen». Consultado el 4 de diciembre de 2012.
- ↑ Biotium Inc. (ed.). «GelRed and GelGreen: Environmentally safe and ultra-sensitive nucleic acid gel stains for replacing EtBr». Consultado el 4 de diciembre de 2012.
Véase también[editar]
Enlaces externos[editar]
