Depsipéptido

De Wikipedia, la enciclopedia libre

Un depsipéptido es un péptido en el que uno o más de sus grupos amida, -C(O)NHR-, han sido reemplazados por el correspondiente grupo éster, -C(O)OR,[1]​ Muchos depsipéptidos presentan tanto uniones peptídicas como tipo éster. Se encuentran mayoritariamente en productos naturales de origen marino y microbiano.[2]​

Ejemplo de un depsipéptido con 3 grupos amida (resaltados en azul) y un grupo éster (resaltado en verde). R1 y R3 son grupos orgánicos (e. g. metilo) o un átomo de hidrógeno de los encontrados en ácidos α-hidroxicarboxílicos. R2, R4 y R5 son grupos orgánicos o un átomo de hidrógeno de los encontrados en aminoácidos comunes.

Productos naturales depsipeptídicos[editar]

La enteroquelina es un depsipéptido transportador de hierro.[3]​

Se ha encontrado que varios depsipéptidos muestran propiedades anticancerígenas.[4]​

Un inhibidor enzimático depsipeptídico incluye romidepsina, un miembro de la clase de péptidos bicíclicos, un conocido inhibidor de la histona deacetilasa (HDACi). Se aisló primero como un producto de la fermentación a partir de Chromobacterium violaceum por la compañía farmacéutica Fujisawa.[5]​

Datos preliminares mostraron en 2010 que el antibiótico Etamycin tenía una potente actividad contra SARM en un modelo de ratón.[6]​ Varios depsipéptidos procedentes de Streptomyces muestran actividad antimicrobiana.[7]​[8]​ Estos forman una nueva clase de antibióticos potenciales conocidos como acildepsipéptidos (ADEPs). Los ADEPs tienen como diana y activan la proteasa caseinolítica (ClpP) para iniciar la degradación descontrolada de péptidos y proteínas no plegadas, matando muchas bacterias grampositivas.[9]​[10]​[11]​

Lecturas adicionales[editar]

  • papuamide Ford, PW; Gustafson, KR; McKee, TC; Shigematsu, N; Maurizi, LK; Pannell, LK; Williams, DE; de Silva, ED; Lassota, P; Allen, TM; Van Soest, R; Andersen, RJ; Boyd, MR (1999). «Papuamides A-D, HIV-Inhibitory and Cytotoxic Depsipeptides from the Sponges Theonella mirabilis and Theonella swinhoei Collected in Papua New Guinea». J. Am. Chem. Soc. 121: 5899-5909. doi:10.1021/ja990582o. 
  • neamphamide A Oku, N; Gustafson, KR; Cartner, LK; Wilson, JA; Shigematsu, N; Hess, S; Pannell, LK; Boyd, MR et al. (2004). «Neamphamide A. A new HIV-inhibitory depsipeptide from the Papua New Guinea marine sponge Neamphius huxleyi». J. Nat. Prod. 67 (8): 1407-11. PMID 15332865. doi:10.1021/np040003f. 
  • callipeltin A Zampella, A; D'Auria, MV; Paloma, LG; Casapullo, A; Minale, L; Debitus, C; Henin, Y (1996). «Callipeltin A, an Anti-HIV Cyclic Depsipeptide from the New Caledonian Lithistida Sponge Callipelta sp.». J. Am. Chem. Soc. 118: 6202-9. doi:10.1021/ja954287p. 
  • mirabamides A-D Plaza, A; Gustchina, E; Baker, HL; Kelly, M; Bewley, CA (2007). «Mirabamides A-D. Depsipeptides from the sponge Siliquariaspongia mirabilis that inhibit HIV-1 fusion». J. Nat. Prod. 70 (11): 1753-60. PMID 17963357. doi:10.1021/np070306k. ; Andjelic, CD; Planelles, V; Barrows, LR (2008). «Characterizing the Anti-HIV Activity of Papuamide A.». Mar Drugs 6 (4): 528-49. PMC 2630844. PMID 19172193. doi:10.3390/md20080027. 

Referencias[editar]

  1. ↑ Unión Internacional de Química Pura y Aplicada. «depsipeptides». Compendium of Chemical Terminology. Versión en línea (en inglés).
  2. ↑ Yasumasa Hamada, Takayuki Shioiri (2005). «Recent Progress of the Synthetic Studies of Biologically Active Marine Cyclic Peptides and Depsipeptides». Chem. Rev. 105: 4441-4482. doi:10.1021/cr0406312. 
  3. ↑ Walsh, Christopher T., Jun Liu, Frank Rusnak, and Masahiro Sakaitani (1990). «Molecular Studies on Enzymes in Chorismate Metabolism and the Enterobactin Biosynthetic Pathway». Chemical Reviews 90 (7): 1105-1129. doi:10.1021/cr00105a003. 
  4. ↑ Kitagaki, J.; Shi, G.; Miyauchi, S.; Murakami, S.; Yang, Y. (2015). «Cyclic depsipeptides as potential cancer therapeutics». Anticancer Drugs 26: 259-71. PMID 25419631. doi:10.1097/CAD.0000000000000183. 
  5. ↑ Yurek-George, Alexander; Cecil, Alexander Richard Liam; Mo, Alex Hon Kit; Wen, Shijun; Rogers, Helen; Habens, Fay; Maeda, Satoko; Yoshida, Minoru et al. (2007). «The First Biologically Active Synthetic Analogues of FK228, the Depsipeptide Histone Deacetylase Inhibitor». Journal of Medicinal Chemistry 50 (23): 5720-5726. PMID 17958342. doi:10.1021/jm0703800. 
  6. ↑ Haste, Nina M; Perera, Varahenage R; Maloney, Katherine N; Tran, Dan N; Jensen, Paul; Fenical, William; Nizet, Victor; Hensler, Mary E (2010). «Activity of the streptogramin antibiotic etamycin against methicillin-resistant Staphylococcus aureus». Journal of Antibiotics 63 (5): 219. PMC 2889693. PMID 20339399. doi:10.1038/ja.2010.22. 
  7. ↑ K. H. Michel, R. E. Kastner (Eli Lilly and Company), US 4492650, 1985 [Chem. Abstr. 1985, 102, 130459]
  8. ↑ Osada, Hiroyuki; Yano, Tatsuya; Koshino, Hiroyuki; Isono, Kiyoshi (1991). «Enopeptin A, a novel depsipeptide antibiotic with anti-bacteriophage activity». The Journal of Antibiotics 44 (12): 1463-1466. doi:10.7164/antibiotics.44.1463. 
  9. ↑ Li; Him Shun, Dominic; Guarné, Alba; Maurizi, Michael R.; Cheng, Yi-Qiang; Wright, Gerard D.; Ghirlando, Rodolfo; Joseph, Ebenezer; Gloyd, Melanie; Seon Chung, Yu; Ortega, Joaquin (2010). «Acyldepsipeptide Antibiotics Induce The Formation Of A Structured Axial Channel In ClpP: A Model For The ClpX/ClpA-Bound State Of ClpP». Chemistry & Biology 17 (9): 959-969. PMC 2955292. PMID 20851345. doi:10.1016/j.chembiol.2010.07.008. 
  10. ↑ Hinzen, Berthold; Labischinski, Harald; Brötz-Oesterhelt, Heike; Endermann, Rainer; Benet-Buchholz, Jordi; Hellwig, Veronica; Häbich, Dieter; Schumacher, Andreas; Lampe, Thomas; Paulsen, Holger; Raddatz, Siegfried (2006). «Medicinal Chemistry Optimization of Acyldepsipeptides of the Enopeptin Class Antibiotics». ChemMedChem 1 (7): 689-693. PMID 16902918. doi:10.1002/cmdc.200600055. 
  11. ↑ Carney, Daniel W.; Schmitz, Karl R.; Truong, Jonathan V.; Sauer, Robert T.; Sello, Jason K. (2014). «Restriction of the Conformational Dynamics of the Cyclic Acyldepsipeptide Antibiotics Improves Their Antibacterial Activity». JACS 136: 1922-1929. doi:10.1021/ja410385c. 
Obtenido de «https://es.wikipedia.org/w/index.php?title=Depsipéptido&oldid=159534957»